Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r209Q5NC97 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r209Q5NC97 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms