Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWR2

Khdc1a, KH homology domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1aQ3UWR2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1aQ3UWR2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1aQ3UWR2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1aQ3UWR2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1aQ3UWR2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1aQ3UWR2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1aQ3UWR2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1aQ3UWR2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1aQ3UWR2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1aQ3UWR2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms