Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm29609Q3UU56 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm29609Q3UU56 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm29609Q3UU56 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm29609Q3UU56 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm29609Q3UU56 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm29609Q3UU56 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm29609Q3UU56 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm29609Q3UU56 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm29609Q3UU56 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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