Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS3

Drc1, Dynein regulatory complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc1Q3USS3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Drc1Q3USS3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Drc1Q3USS3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms