Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitpnm3Q3UHE1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitpnm3Q3UHE1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms