Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms