Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnft2Q3UF64 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft2Q3UF64 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms