Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdgfl1Q2VPR5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms