Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NrepQ07475 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NrepQ07475 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms