Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk18Q04899 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk18Q04899 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk18Q04899 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk18Q04899 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms