Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox8Q04886 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox8Q04886 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox8Q04886 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms