Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RelaQ04207 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RelaQ04207 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RelaQ04207 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RelaQ04207 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RelaQ04207 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RelaQ04207 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelaQ04207 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RelaQ04207 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms