Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkcqQ02111 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms