Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ly9Q01965 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly9Q01965 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly9Q01965 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms