Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd80Q00609 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd80Q00609 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd80Q00609 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms