Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8a1P70704 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp8a1P70704 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp8a1P70704 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms