Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf6P70196 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf6P70196 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf6P70196 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf6P70196 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf6P70196 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf6P70196 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf6P70196 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Traf6P70196 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf6P70196 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms