Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrig1P70193 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrig1P70193 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms