Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vamp3P63024 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp3P63024 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp3P63024 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms