Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrpfP62307 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpfP62307 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms