Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd4P58467 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd4P58467 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd4P58467 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd4P58467 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd4P58467 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd4P58467 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd4P58467 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd4P58467 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd4P58467 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd4P58467 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setd4P58467 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd4P58467 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms