Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NcstnP57716 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NcstnP57716 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NcstnP57716 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NcstnP57716 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NcstnP57716 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms