Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr5P51682 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr5P51682 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr5P51682 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms