Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax7P47239 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax7P47239 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pax7P47239 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax7P47239 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax7P47239 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax7P47239 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pax7P47239 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms