Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifnar1P33896 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnar1P33896 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms