Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa11P31311 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms