Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnd2P30280 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnd2P30280 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnd2P30280 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnd2P30280 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnd2P30280 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnd2P30280 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccnd2P30280 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnd2P30280 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd2P30280 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd2P30280 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms