Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OatP29758 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OatP29758 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OatP29758 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OatP29758 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OatP29758 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OatP29758 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OatP29758 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OatP29758 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OatP29758 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OatP29758 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OatP29758 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OatP29758 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OatP29758 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OatP29758 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OatP29758 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OatP29758 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OatP29758 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OatP29758 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OatP29758 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OatP29758 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OatP29758 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OatP29758 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OatP29758 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OatP29758 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
OatP29758 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OatP29758 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OatP29758 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OatP29758 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OatP29758 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OatP29758 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OatP29758 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OatP29758 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OatP29758 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OatP29758 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OatP29758 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OatP29758 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OatP29758 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OatP29758 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OatP29758 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OatP29758 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OatP29758 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OatP29758 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OatP29758 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OatP29758 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OatP29758 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OatP29758 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OatP29758 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OatP29758 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OatP29758 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OatP29758 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OatP29758 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OatP29758 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OatP29758 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OatP29758 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OatP29758 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OatP29758 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OatP29758 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OatP29758 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OatP29758 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OatP29758 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OatP29758 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OatP29758 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OatP29758 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OatP29758 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OatP29758 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OatP29758 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OatP29758 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OatP29758 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OatP29758 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OatP29758 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OatP29758 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OatP29758 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OatP29758 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OatP29758 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OatP29758 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OatP29758 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OatP29758 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OatP29758 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OatP29758 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OatP29758 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OatP29758 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OatP29758 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OatP29758 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OatP29758 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OatP29758 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OatP29758 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms