Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vcam1P29533 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vcam1P29533 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms