Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LoxP28301 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LoxP28301 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LoxP28301 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LoxP28301 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LoxP28301 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LoxP28301 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LoxP28301 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LoxP28301 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LoxP28301 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LoxP28301 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LoxP28301 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LoxP28301 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LoxP28301 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LoxP28301 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LoxP28301 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LoxP28301 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LoxP28301 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LoxP28301 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LoxP28301 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LoxP28301 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LoxP28301 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LoxP28301 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LoxP28301 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LoxP28301 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LoxP28301 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LoxP28301 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LoxP28301 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LoxP28301 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LoxP28301 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LoxP28301 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LoxP28301 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LoxP28301 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LoxP28301 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LoxP28301 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LoxP28301 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LoxP28301 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LoxP28301 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LoxP28301 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LoxP28301 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LoxP28301 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LoxP28301 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LoxP28301 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LoxP28301 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LoxP28301 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LoxP28301 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LoxP28301 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LoxP28301 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LoxP28301 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LoxP28301 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LoxP28301 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LoxP28301 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LoxP28301 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LoxP28301 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LoxP28301 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LoxP28301 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LoxP28301 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LoxP28301 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LoxP28301 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LoxP28301 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LoxP28301 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LoxP28301 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LoxP28301 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LoxP28301 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LoxP28301 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LoxP28301 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LoxP28301 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LoxP28301 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LoxP28301 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LoxP28301 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LoxP28301 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LoxP28301 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LoxP28301 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms