Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd247P24161 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd247P24161 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd247P24161 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd247P24161 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd247P24161 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd247P24161 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd247P24161 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd247P24161 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd247P24161 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd247P24161 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd247P24161 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd247P24161 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd247P24161 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd247P24161 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd247P24161 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd247P24161 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd247P24161 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd247P24161 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd247P24161 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd247P24161 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd247P24161 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd247P24161 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd247P24161 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd247P24161 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd247P24161 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd247P24161 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd247P24161 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd247P24161 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd247P24161 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd247P24161 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd247P24161 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd247P24161 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd247P24161 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd247P24161 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd247P24161 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms