Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TP20293 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TP20293 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TP20293 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TP20293 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TP20293 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TP20293 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TP20293 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TP20293 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TP20293 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TP20293 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TP20293 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TP20293 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TP20293 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TP20293 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TP20293 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TP20293 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TP20293 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TP20293 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TP20293 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TP20293 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TP20293 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TP20293 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TP20293 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TP20293 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TP20293 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TP20293 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TP20293 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TP20293 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TP20293 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TP20293 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TP20293 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TP20293 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TP20293 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TP20293 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TP20293 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TP20293 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TP20293 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TP20293 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TP20293 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TP20293 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TP20293 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TP20293 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TP20293 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TP20293 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TP20293 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TP20293 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TP20293 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TP20293 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TP20293 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TP20293 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TP20293 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TP20293 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TP20293 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TP20293 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP20293 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP20293 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP20293 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP20293 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TP20293 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TP20293 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP20293 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP20293 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP20293 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TP20293 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TP20293 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms