Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxb1P17919 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxb1P17919 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms