Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrgnP13609 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SrgnP13609 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SrgnP13609 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SrgnP13609 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrgnP13609 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrgnP13609 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrgnP13609 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrgnP13609 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrgnP13609 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrgnP13609 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrgnP13609 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrgnP13609 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrgnP13609 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrgnP13609 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrgnP13609 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrgnP13609 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SrgnP13609 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrgnP13609 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SrgnP13609 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrgnP13609 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrgnP13609 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrgnP13609 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SrgnP13609 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SrgnP13609 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrgnP13609 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SrgnP13609 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrgnP13609 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrgnP13609 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SrgnP13609 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrgnP13609 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SrgnP13609 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrgnP13609 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrgnP13609 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrgnP13609 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SrgnP13609 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SrgnP13609 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrgnP13609 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrgnP13609 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrgnP13609 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SrgnP13609 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrgnP13609 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms