Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnfP06804 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnfP06804 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnfP06804 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TnfP06804 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnfP06804 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnfP06804 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnfP06804 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnfP06804 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnfP06804 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnfP06804 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnfP06804 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnfP06804 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnfP06804 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnfP06804 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnfP06804 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnfP06804 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnfP06804 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnfP06804 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TnfP06804 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TnfP06804 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TnfP06804 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TnfP06804 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TnfP06804 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TnfP06804 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TnfP06804 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TnfP06804 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TnfP06804 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TnfP06804 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TnfP06804 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TnfP06804 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TnfP06804 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TnfP06804 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TnfP06804 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TnfP06804 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TnfP06804 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TnfP06804 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TnfP06804 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TnfP06804 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TnfP06804 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TnfP06804 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TnfP06804 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TnfP06804 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TnfP06804 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TnfP06804 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TnfP06804 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TnfP06804 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TnfP06804 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TnfP06804 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TnfP06804 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TnfP06804 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TnfP06804 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TnfP06804 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TnfP06804 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TnfP06804 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TnfP06804 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TnfP06804 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TnfP06804 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TnfP06804 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TnfP06804 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TnfP06804 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TnfP06804 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TnfP06804 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TnfP06804 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TnfP06804 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TnfP06804 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TnfP06804 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TnfP06804 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TnfP06804 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TnfP06804 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnfP06804 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnfP06804 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TnfP06804 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnfP06804 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnfP06804 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnfP06804 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnfP06804 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnfP06804 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnfP06804 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnfP06804 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnfP06804 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnfP06804 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnfP06804 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnfP06804 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnfP06804 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnfP06804 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnfP06804 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnfP06804 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnfP06804 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnfP06804 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TnfP06804 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnfP06804 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnfP06804 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnfP06804 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnfP06804 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnfP06804 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnfP06804 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnfP06804 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnfP06804 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnfP06804 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms