Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P06323 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P06323 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P06323 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P06323 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P06323 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P06323 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P06323 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P06323 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P06323 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P06323 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P06323 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P06323 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06323 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06323 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06323 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06323 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06323 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06323 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06323 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06323 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06323 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06323 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06323 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06323 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06323 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06323 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P06323 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P06323 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06323 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06323 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06323 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06323 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06323 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06323 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06323 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06323 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06323 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06323 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06323 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06323 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06323 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06323 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06323 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06323 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06323 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P06323 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06323 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms