Protein–RNA interactions for Protein: P02469

Lamb1, Laminin subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb1P02469 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamb1P02469 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb1P02469 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb1P02469 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms