Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Odc1P00860 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Odc1P00860 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odc1P00860 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odc1P00860 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odc1P00860 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odc1P00860 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odc1P00860 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odc1P00860 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odc1P00860 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odc1P00860 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odc1P00860 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odc1P00860 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms