Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfnO70456 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfnO70456 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfnO70456 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfnO70456 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SfnO70456 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfnO70456 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfnO70456 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SfnO70456 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfnO70456 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SfnO70456 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SfnO70456 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SfnO70456 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SfnO70456 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SfnO70456 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SfnO70456 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SfnO70456 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SfnO70456 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SfnO70456 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SfnO70456 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SfnO70456 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SfnO70456 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SfnO70456 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SfnO70456 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SfnO70456 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SfnO70456 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SfnO70456 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SfnO70456 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SfnO70456 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SfnO70456 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SfnO70456 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SfnO70456 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfnO70456 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfnO70456 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfnO70456 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfnO70456 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfnO70456 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SfnO70456 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SfnO70456 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SfnO70456 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SfnO70456 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SfnO70456 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SfnO70456 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SfnO70456 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SfnO70456 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SfnO70456 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SfnO70456 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SfnO70456 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SfnO70456 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfnO70456 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfnO70456 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfnO70456 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfnO70456 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SfnO70456 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfnO70456 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfnO70456 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfnO70456 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfnO70456 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfnO70456 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SfnO70456 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfnO70456 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfnO70456 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfnO70456 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfnO70456 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SfnO70456 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SfnO70456 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SfnO70456 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SfnO70456 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SfnO70456 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SfnO70456 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SfnO70456 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfnO70456 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfnO70456 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfnO70456 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfnO70456 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms