Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb5O70309 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb5O70309 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb5O70309 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb5O70309 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb5O70309 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb5O70309 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb5O70309 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb5O70309 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb5O70309 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms