Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trdmt1O55055 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trdmt1O55055 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trdmt1O55055 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms