Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb2O55029 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb2O55029 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb2O55029 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copb2O55029 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copb2O55029 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copb2O55029 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copb2O55029 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb2O55029 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb2O55029 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb2O55029 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Copb2O55029 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Copb2O55029 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms