Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxO54751 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxO54751 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxO54751 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxO54751 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxO54751 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxO54751 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxO54751 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxO54751 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxO54751 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxO54751 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxO54751 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrxO54751 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrxO54751 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxO54751 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxO54751 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxO54751 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxO54751 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrxO54751 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrxO54751 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrxO54751 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxO54751 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrxO54751 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxO54751 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxO54751 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrxO54751 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrxO54751 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxO54751 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxO54751 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrxO54751 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxO54751 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrxO54751 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CrxO54751 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxO54751 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxO54751 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxO54751 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxO54751 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrxO54751 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrxO54751 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrxO54751 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CrxO54751 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxO54751 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxO54751 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CrxO54751 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CrxO54751 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CrxO54751 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxO54751 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxO54751 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxO54751 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CrxO54751 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CrxO54751 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrxO54751 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxO54751 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxO54751 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxO54751 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxO54751 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxO54751 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxO54751 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxO54751 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrxO54751 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrxO54751 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrxO54751 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms