Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk2O35491 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk2O35491 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk2O35491 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk2O35491 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk2O35491 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk2O35491 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk2O35491 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk2O35491 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk2O35491 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk2O35491 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms