Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna5O08543 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna5O08543 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna5O08543 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna5O08543 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efna5O08543 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efna5O08543 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efna5O08543 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efna5O08543 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efna5O08543 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efna5O08543 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna5O08543 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna5O08543 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna5O08543 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna5O08543 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna5O08543 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna5O08543 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna5O08543 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna5O08543 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna5O08543 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efna5O08543 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms