Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna2d1O08532 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna2d1O08532 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms