Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm4340L7N2C4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm4340L7N2C4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm4340L7N2C4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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