Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AK157302I3ITR1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AK157302I3ITR1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AK157302I3ITR1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AK157302I3ITR1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AK157302I3ITR1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AK157302I3ITR1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AK157302I3ITR1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AK157302I3ITR1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AK157302I3ITR1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms