Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfip1G5E8V9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfip1G5E8V9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfip1G5E8V9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms