Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa35E9QLQ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa35E9QLQ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms