Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f1E9Q9P8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rdh16f1E9Q9P8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rdh16f1E9Q9P8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Rdh16f1E9Q9P8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Rdh16f1E9Q9P8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Rdh16f1E9Q9P8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms